La Dirección general de Epidemiología (DGE) como órgano de línea del Ministerio de Salud, es el responsable de conducir el Sistema de Vigilancia Epidemiológica en Salud Pública y del análisis de situación de salud del Perú y tiene las siguientes funcionales generales de acuerdo al Decreto Supremo Nº 023-2005-SA (Reglamento de organización y funciones del Ministerio de Salud) publicado el 01 de enero de 2006, y el anexo publicado el 05 de enero en El Peruano, se convierte de Oficina General de Epidemiología en Dirección General de Epidemiología:
- Diseñar, normar y conducir el Sistema Nacional de Vigilancia Epidemiológica en Salud Pública, en el ámbito nacional
- Diseñar, normar y conducir el proceso de análisis de la situación de salud para la determinación de prioridades sanitarias, como base del planeamiento estratégico en salud.
- Implementar y desarrollar el sistema de Inteligencia Sanitaria articulando los diferentes sistemas de información y planificación sanitaria.
- Promover y desarrollar la capacitación en servicio y entrenamiento especializado en epidemiologías de los recursos humanos del Sector Salud, desarrollando competencias en Vigilancia Epidemiológica en salud pública, análisis de la situación de salud, respuesta ante brotes, emergencias sanitarias, así como investigación epidemiológica.
- Promover, ejecutar y difundir las investigaciones epidemiológicas aplicadas, que permitan la generación de evidencias científicas en salud pública para la prevención y control de los daños y riesgos que afectan la salud de la población.
- Diseñar y mejorar continuamente el proceso de prevención y control de epidemias, emergencias y desastres, en coordinación con la Dirección General de Salud de las Personas, la Oficina General de Defensa Nacional y otros órganos involucrados.
- Establecer las bases epidemiológicas para la prevención y control de las enfermedades transmisibles y no trasmisibles en el Perú.
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